Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mmp13P33435 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mmp13P33435 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mmp13P33435 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp13P33435 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp13P33435 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp13P33435 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp13P33435 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp13P33435 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp13P33435 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp13P33435 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp13P33435 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp13P33435 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp13P33435 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms