Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SsbP32067 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SsbP32067 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SsbP32067 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SsbP32067 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SsbP32067 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SsbP32067 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SsbP32067 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SsbP32067 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SsbP32067 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SsbP32067 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SsbP32067 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SsbP32067 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SsbP32067 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SsbP32067 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SsbP32067 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SsbP32067 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SsbP32067 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SsbP32067 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SsbP32067 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SsbP32067 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SsbP32067 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SsbP32067 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SsbP32067 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SsbP32067 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SsbP32067 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SsbP32067 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SsbP32067 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SsbP32067 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SsbP32067 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SsbP32067 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SsbP32067 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SsbP32067 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SsbP32067 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SsbP32067 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SsbP32067 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SsbP32067 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SsbP32067 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SsbP32067 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SsbP32067 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SsbP32067 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SsbP32067 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SsbP32067 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SsbP32067 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SsbP32067 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SsbP32067 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SsbP32067 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SsbP32067 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SsbP32067 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SsbP32067 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SsbP32067 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SsbP32067 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SsbP32067 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SsbP32067 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SsbP32067 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SsbP32067 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SsbP32067 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SsbP32067 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SsbP32067 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SsbP32067 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SsbP32067 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SsbP32067 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SsbP32067 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SsbP32067 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SsbP32067 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SsbP32067 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SsbP32067 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SsbP32067 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SsbP32067 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SsbP32067 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SsbP32067 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SsbP32067 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SsbP32067 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SsbP32067 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SsbP32067 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SsbP32067 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SsbP32067 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SsbP32067 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SsbP32067 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SsbP32067 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SsbP32067 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SsbP32067 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SsbP32067 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SsbP32067 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SsbP32067 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SsbP32067 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SsbP32067 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SsbP32067 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SsbP32067 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SsbP32067 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SsbP32067 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SsbP32067 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SsbP32067 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SsbP32067 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SsbP32067 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SsbP32067 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SsbP32067 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SsbP32067 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SsbP32067 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SsbP32067 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms