Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-DMaP28078 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-DMaP28078 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-DMaP28078 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2-DMaP28078 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-DMaP28078 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms