Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2afxP27661 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2afxP27661 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2afxP27661 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afxP27661 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afxP27661 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afxP27661 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2afxP27661 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
H2afxP27661 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2afxP27661 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
H2afxP27661 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2afxP27661 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
H2afxP27661 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2afxP27661 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2afxP27661 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2afxP27661 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2afxP27661 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2afxP27661 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2afxP27661 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms