Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2af2P26369 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af2P26369 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af2P26369 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af2P26369 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af2P26369 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af2P26369 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2af2P26369 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2af2P26369 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2af2P26369 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2af2P26369 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2af2P26369 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
U2af2P26369 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2af2P26369 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
U2af2P26369 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2af2P26369 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2af2P26369 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af2P26369 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af2P26369 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af2P26369 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2af2P26369 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af2P26369 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af2P26369 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af2P26369 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af2P26369 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af2P26369 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af2P26369 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af2P26369 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2af2P26369 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2af2P26369 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2af2P26369 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2af2P26369 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2af2P26369 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2af2P26369 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2af2P26369 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af2P26369 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af2P26369 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2af2P26369 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af2P26369 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af2P26369 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af2P26369 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af2P26369 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af2P26369 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af2P26369 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af2P26369 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2af2P26369 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2af2P26369 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af2P26369 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af2P26369 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms