Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edn1P22387 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edn1P22387 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edn1P22387 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Edn1P22387 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Edn1P22387 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Edn1P22387 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Edn1P22387 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Edn1P22387 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edn1P22387 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Edn1P22387 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Edn1P22387 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Edn1P22387 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Edn1P22387 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edn1P22387 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Edn1P22387 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms