Protein–RNA interactions for Protein: P21658

Fgf6, Fibroblast growth factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf6P21658 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf6P21658 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf6P21658 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf6P21658 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf6P21658 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf6P21658 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf6P21658 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf6P21658 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf6P21658 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf6P21658 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgf6P21658 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf6P21658 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf6P21658 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms