Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ntf3P20181 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ntf3P20181 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntf3P20181 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ntf3P20181 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ntf3P20181 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ntf3P20181 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ntf3P20181 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ntf3P20181 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ntf3P20181 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf3P20181 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf3P20181 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ntf3P20181 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf3P20181 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf3P20181 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf3P20181 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf3P20181 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ntf3P20181 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ntf3P20181 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ntf3P20181 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ntf3P20181 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ntf3P20181 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ntf3P20181 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ntf3P20181 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ntf3P20181 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms