Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MgpP19788 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MgpP19788 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MgpP19788 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MgpP19788 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MgpP19788 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MgpP19788 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MgpP19788 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MgpP19788 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MgpP19788 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MgpP19788 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MgpP19788 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MgpP19788 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MgpP19788 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MgpP19788 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MgpP19788 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MgpP19788 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MgpP19788 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MgpP19788 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MgpP19788 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MgpP19788 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MgpP19788 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MgpP19788 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MgpP19788 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MgpP19788 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MgpP19788 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MgpP19788 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MgpP19788 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MgpP19788 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MgpP19788 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MgpP19788 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MgpP19788 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MgpP19788 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MgpP19788 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MgpP19788 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MgpP19788 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MgpP19788 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MgpP19788 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MgpP19788 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MgpP19788 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MgpP19788 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MgpP19788 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MgpP19788 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MgpP19788 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MgpP19788 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MgpP19788 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MgpP19788 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MgpP19788 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MgpP19788 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MgpP19788 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MgpP19788 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MgpP19788 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MgpP19788 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MgpP19788 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MgpP19788 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MgpP19788 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MgpP19788 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MgpP19788 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MgpP19788 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MgpP19788 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MgpP19788 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MgpP19788 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MgpP19788 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MgpP19788 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MgpP19788 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MgpP19788 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MgpP19788 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MgpP19788 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MgpP19788 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MgpP19788 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MgpP19788 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MgpP19788 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MgpP19788 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MgpP19788 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MgpP19788 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MgpP19788 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MgpP19788 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MgpP19788 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MgpP19788 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MgpP19788 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MgpP19788 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MgpP19788 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MgpP19788 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MgpP19788 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MgpP19788 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MgpP19788 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MgpP19788 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MgpP19788 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MgpP19788 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MgpP19788 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MgpP19788 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MgpP19788 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MgpP19788 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MgpP19788 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MgpP19788 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MgpP19788 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MgpP19788 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MgpP19788 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MgpP19788 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MgpP19788 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms