Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox4i1P19783 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox4i1P19783 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox4i1P19783 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cox4i1P19783 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cox4i1P19783 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cox4i1P19783 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cox4i1P19783 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms