Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgn1P18608 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn1P18608 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn1P18608 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hmgn1P18608 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgn1P18608 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn1P18608 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn1P18608 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms