Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh2P15116 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh2P15116 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh2P15116 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh2P15116 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh2P15116 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh2P15116 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms