Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FosbP13346 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FosbP13346 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FosbP13346 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FosbP13346 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FosbP13346 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FosbP13346 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FosbP13346 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FosbP13346 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FosbP13346 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FosbP13346 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FosbP13346 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FosbP13346 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FosbP13346 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FosbP13346 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FosbP13346 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FosbP13346 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FosbP13346 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FosbP13346 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FosbP13346 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FosbP13346 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FosbP13346 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FosbP13346 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FosbP13346 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FosbP13346 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FosbP13346 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FosbP13346 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FosbP13346 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FosbP13346 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FosbP13346 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FosbP13346 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FosbP13346 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FosbP13346 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FosbP13346 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FosbP13346 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FosbP13346 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FosbP13346 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FosbP13346 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FosbP13346 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FosbP13346 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FosbP13346 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FosbP13346 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FosbP13346 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FosbP13346 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FosbP13346 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FosbP13346 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FosbP13346 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FosbP13346 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FosbP13346 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FosbP13346 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FosbP13346 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FosbP13346 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FosbP13346 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FosbP13346 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FosbP13346 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FosbP13346 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FosbP13346 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FosbP13346 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FosbP13346 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FosbP13346 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FosbP13346 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FosbP13346 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FosbP13346 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FosbP13346 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FosbP13346 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FosbP13346 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FosbP13346 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FosbP13346 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FosbP13346 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FosbP13346 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FosbP13346 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FosbP13346 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FosbP13346 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FosbP13346 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FosbP13346 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FosbP13346 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FosbP13346 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FosbP13346 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FosbP13346 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FosbP13346 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FosbP13346 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FosbP13346 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FosbP13346 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FosbP13346 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FosbP13346 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FosbP13346 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FosbP13346 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FosbP13346 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FosbP13346 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FosbP13346 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FosbP13346 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FosbP13346 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FosbP13346 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FosbP13346 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FosbP13346 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FosbP13346 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FosbP13346 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FosbP13346 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FosbP13346 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FosbP13346 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms