Protein–RNA interactions for Protein: P11835

Itgb2, Integrin beta-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb2P11835 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb2P11835 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itgb2P11835 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb2P11835 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb2P11835 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb2P11835 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb2P11835 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb2P11835 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb2P11835 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb2P11835 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb2P11835 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb2P11835 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb2P11835 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb2P11835 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb2P11835 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb2P11835 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb2P11835 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb2P11835 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb2P11835 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb2P11835 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb2P11835 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb2P11835 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb2P11835 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb2P11835 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb2P11835 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb2P11835 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb2P11835 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms