Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd4P10628 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd4P10628 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd4P10628 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd4P10628 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4P10628 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4P10628 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4P10628 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4P10628 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4P10628 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4P10628 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4P10628 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4P10628 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4P10628 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4P10628 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd4P10628 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd4P10628 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms