Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp28P10078 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp28P10078 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp28P10078 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp28P10078 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp28P10078 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp28P10078 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms