Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Becn2P0DM65 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Becn2P0DM65 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Becn2P0DM65 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Becn2P0DM65 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Becn2P0DM65 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Becn2P0DM65 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Becn2P0DM65 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Becn2P0DM65 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Becn2P0DM65 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Becn2P0DM65 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Becn2P0DM65 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Becn2P0DM65 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Becn2P0DM65 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Becn2P0DM65 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Becn2P0DM65 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms