Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NefmP08553 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NefmP08553 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NefmP08553 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NefmP08553 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NefmP08553 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NefmP08553 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NefmP08553 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NefmP08553 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NefmP08553 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NefmP08553 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NefmP08553 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NefmP08553 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
NefmP08553 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NefmP08553 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NefmP08553 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NefmP08553 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NefmP08553 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NefmP08553 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NefmP08553 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NefmP08553 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NefmP08553 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NefmP08553 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NefmP08553 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NefmP08553 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NefmP08553 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NefmP08553 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NefmP08553 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NefmP08553 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NefmP08553 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NefmP08553 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NefmP08553 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NefmP08553 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NefmP08553 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NefmP08553 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NefmP08553 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NefmP08553 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
NefmP08553 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NefmP08553 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
NefmP08553 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NefmP08553 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NefmP08553 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NefmP08553 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NefmP08553 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NefmP08553 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NefmP08553 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NefmP08553 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NefmP08553 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NefmP08553 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NefmP08553 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NefmP08553 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NefmP08553 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NefmP08553 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NefmP08553 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NefmP08553 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NefmP08553 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NefmP08553 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NefmP08553 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NefmP08553 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NefmP08553 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NefmP08553 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NefmP08553 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NefmP08553 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NefmP08553 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NefmP08553 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NefmP08553 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NefmP08553 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NefmP08553 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NefmP08553 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NefmP08553 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NefmP08553 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NefmP08553 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NefmP08553 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NefmP08553 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NefmP08553 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NefmP08553 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NefmP08553 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NefmP08553 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NefmP08553 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NefmP08553 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NefmP08553 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NefmP08553 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NefmP08553 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NefmP08553 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NefmP08553 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NefmP08553 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NefmP08553 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NefmP08553 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NefmP08553 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NefmP08553 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NefmP08553 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NefmP08553 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NefmP08553 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NefmP08553 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NefmP08553 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NefmP08553 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NefmP08553 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NefmP08553 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NefmP08553 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NefmP08553 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms