Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcrg-V1P06325 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcrg-V1P06325 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcrg-V1P06325 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcrg-V1P06325 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcrg-V1P06325 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcrg-V1P06325 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcrg-V1P06325 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcrg-V1P06325 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcrg-V1P06325 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcrg-V1P06325 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcrg-V1P06325 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms