Protein–RNA interactions for Protein: P04247

Mb, Myoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MbP04247 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MbP04247 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MbP04247 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MbP04247 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MbP04247 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MbP04247 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MbP04247 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MbP04247 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MbP04247 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MbP04247 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MbP04247 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MbP04247 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MbP04247 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MbP04247 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MbP04247 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MbP04247 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MbP04247 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MbP04247 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MbP04247 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MbP04247 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MbP04247 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MbP04247 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MbP04247 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MbP04247 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MbP04247 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MbP04247 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MbP04247 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MbP04247 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MbP04247 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MbP04247 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MbP04247 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MbP04247 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MbP04247 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MbP04247 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MbP04247 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MbP04247 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MbP04247 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MbP04247 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MbP04247 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MbP04247 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MbP04247 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MbP04247 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MbP04247 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MbP04247 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MbP04247 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MbP04247 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MbP04247 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MbP04247 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MbP04247 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MbP04247 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MbP04247 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MbP04247 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MbP04247 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MbP04247 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MbP04247 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MbP04247 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MbP04247 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MbP04247 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MbP04247 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MbP04247 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MbP04247 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MbP04247 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MbP04247 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MbP04247 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MbP04247 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MbP04247 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MbP04247 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MbP04247 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MbP04247 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MbP04247 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MbP04247 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MbP04247 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MbP04247 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MbP04247 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MbP04247 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MbP04247 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MbP04247 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MbP04247 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MbP04247 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MbP04247 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MbP04247 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MbP04247 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MbP04247 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MbP04247 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MbP04247 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MbP04247 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MbP04247 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MbP04247 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MbP04247 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MbP04247 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MbP04247 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MbP04247 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MbP04247 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MbP04247 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MbP04247 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MbP04247 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MbP04247 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MbP04247 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MbP04247 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MbP04247 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms