Protein–RNA interactions for Protein: P01869

Ighg1, Ig gamma-1 chain C region, membrane-bound form, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg1P01869 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighg1P01869 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighg1P01869 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighg1P01869 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ighg1P01869 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighg1P01869 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighg1P01869 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighg1P01869 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighg1P01869 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighg1P01869 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighg1P01869 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighg1P01869 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighg1P01869 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighg1P01869 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighg1P01869 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms