Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01669 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01669 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01669 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01669 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01669 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01669 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01669 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01669 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
P01669 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01669 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01669 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01669 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01669 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01669 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01669 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01669 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01669 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P01669 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01669 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01669 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01669 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01669 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
P01669 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P01669 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01669 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01669 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P01669 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01669 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01669 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01669 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01669 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01669 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01669 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01669 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01669 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
P01669 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01669 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01669 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01669 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01669 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01669 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01669 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01669 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01669 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01669 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01669 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01669 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01669 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01669 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01669 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01669 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01669 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01669 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01669 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01669 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01669 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01669 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01669 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01669 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01669 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01669 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P01669 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01669 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01669 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01669 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01669 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01669 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01669 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01669 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01669 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01669 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01669 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01669 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01669 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01669 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P01669 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01669 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01669 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01669 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01669 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01669 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01669 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01669 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01669 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01669 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01669 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01669 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01669 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01669 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01669 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01669 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01669 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01669 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01669 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01669 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01669 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01669 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01669 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
P01669 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms