Protein–RNA interactions for Protein: O88329

Myo1a, Unconventional myosin-Ia, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1aO88329 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo1aO88329 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo1aO88329 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myo1aO88329 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo1aO88329 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Myo1aO88329 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myo1aO88329 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myo1aO88329 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myo1aO88329 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myo1aO88329 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myo1aO88329 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myo1aO88329 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myo1aO88329 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myo1aO88329 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myo1aO88329 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myo1aO88329 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myo1aO88329 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myo1aO88329 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myo1aO88329 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myo1aO88329 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myo1aO88329 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Myo1aO88329 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Myo1aO88329 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Myo1aO88329 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Myo1aO88329 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Myo1aO88329 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Myo1aO88329 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Myo1aO88329 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Myo1aO88329 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Myo1aO88329 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Myo1aO88329 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo1aO88329 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms