Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxq1O70220 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxq1O70220 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxq1O70220 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxq1O70220 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxq1O70220 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxq1O70220 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxq1O70220 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxq1O70220 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxq1O70220 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxq1O70220 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxq1O70220 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxq1O70220 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxq1O70220 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxq1O70220 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxq1O70220 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxq1O70220 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxq1O70220 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxq1O70220 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxq1O70220 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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