Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf13O54965 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf13O54965 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf13O54965 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf13O54965 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf13O54965 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf13O54965 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf13O54965 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf13O54965 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf13O54965 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf13O54965 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf13O54965 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf13O54965 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf13O54965 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf13O54965 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf13O54965 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf13O54965 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf13O54965 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf13O54965 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf13O54965 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms