Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpd52l1O54818 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpd52l1O54818 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpd52l1O54818 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tpd52l1O54818 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tpd52l1O54818 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpd52l1O54818 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpd52l1O54818 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpd52l1O54818 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpd52l1O54818 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52l1O54818 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52l1O54818 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52l1O54818 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52l1O54818 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52l1O54818 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tpd52l1O54818 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpd52l1O54818 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tpd52l1O54818 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpd52l1O54818 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpd52l1O54818 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tpd52l1O54818 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpd52l1O54818 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpd52l1O54818 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpd52l1O54818 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpd52l1O54818 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpd52l1O54818 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpd52l1O54818 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tpd52l1O54818 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tpd52l1O54818 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tpd52l1O54818 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms