Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Matn3O35701 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Matn3O35701 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Matn3O35701 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matn3O35701 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Matn3O35701 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Matn3O35701 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matn3O35701 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn3O35701 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn3O35701 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn3O35701 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn3O35701 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matn3O35701 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matn3O35701 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matn3O35701 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn3O35701 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn3O35701 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn3O35701 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn3O35701 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matn3O35701 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms