Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc27a2O35488 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc27a2O35488 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc27a2O35488 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc27a2O35488 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc27a2O35488 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc27a2O35488 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a2O35488 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a2O35488 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc27a2O35488 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc27a2O35488 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a2O35488 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a2O35488 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc27a2O35488 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc27a2O35488 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a2O35488 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a2O35488 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a2O35488 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a2O35488 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a2O35488 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a2O35488 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a2O35488 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a2O35488 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a2O35488 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms