Protein–RNA interactions for Protein: O35047

Psmc3ip, Homologous-pairing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc3ipO35047 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc3ipO35047 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc3ipO35047 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc3ipO35047 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc3ipO35047 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc3ipO35047 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc3ipO35047 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc3ipO35047 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc3ipO35047 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc3ipO35047 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc3ipO35047 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms