Protein–RNA interactions for Protein: O08966

Slc22a1, Solute carrier family 22 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a1O08966 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc22a1O08966 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc22a1O08966 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc22a1O08966 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc22a1O08966 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a1O08966 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc22a1O08966 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc22a1O08966 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc22a1O08966 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a1O08966 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a1O08966 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a1O08966 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc22a1O08966 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc22a1O08966 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a1O08966 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a1O08966 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a1O08966 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a1O08966 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms