Protein–RNA interactions for Protein: J3S6Y1

Tspear, Thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeat-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspearJ3S6Y1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TspearJ3S6Y1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TspearJ3S6Y1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TspearJ3S6Y1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TspearJ3S6Y1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TspearJ3S6Y1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TspearJ3S6Y1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms