Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc191J3QQ27 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc191J3QQ27 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc191J3QQ27 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc191J3QQ27 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc191J3QQ27 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc191J3QQ27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc191J3QQ27 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc191J3QQ27 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc191J3QQ27 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc191J3QQ27 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc191J3QQ27 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc191J3QQ27 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc191J3QQ27 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc191J3QQ27 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc191J3QQ27 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc191J3QQ27 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc191J3QQ27 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc191J3QQ27 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc191J3QQ27 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc191J3QQ27 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc191J3QQ27 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc191J3QQ27 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc191J3QQ27 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc191J3QQ27 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc191J3QQ27 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc191J3QQ27 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms