Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbip1J3QMK2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbip1J3QMK2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bbip1J3QMK2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbip1J3QMK2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbip1J3QMK2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbip1J3QMK2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbip1J3QMK2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbip1J3QMK2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbip1J3QMK2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms