Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc179J3QM76 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc179J3QM76 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc179J3QM76 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms