Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp408H7BX78 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Zfp408H7BX78 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfp408H7BX78 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zfp408H7BX78 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp408H7BX78 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp408H7BX78 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms