Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sclt1G5E861 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sclt1G5E861 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sclt1G5E861 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sclt1G5E861 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sclt1G5E861 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sclt1G5E861 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sclt1G5E861 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sclt1G5E861 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sclt1G5E861 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sclt1G5E861 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sclt1G5E861 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sclt1G5E861 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sclt1G5E861 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sclt1G5E861 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms