Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna9G3X8Z7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna9G3X8Z7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna9G3X8Z7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna9G3X8Z7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna9G3X8Z7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna9G3X8Z7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna9G3X8Z7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Chrna9G3X8Z7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chrna9G3X8Z7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Chrna9G3X8Z7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrna9G3X8Z7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna9G3X8Z7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chrna9G3X8Z7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chrna9G3X8Z7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chrna9G3X8Z7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chrna9G3X8Z7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna9G3X8Z7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna9G3X8Z7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna9G3X8Z7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna9G3X8Z7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna9G3X8Z7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chrna9G3X8Z7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chrna9G3X8Z7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Chrna9G3X8Z7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chrna9G3X8Z7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrna9G3X8Z7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chrna9G3X8Z7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chrna9G3X8Z7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chrna9G3X8Z7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms