Protein–RNA interactions for Protein: F7AXK2

Gm8871, Predicted pseudogene 8871 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8871F7AXK2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8871F7AXK2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8871F7AXK2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm8871F7AXK2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8871F7AXK2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8871F7AXK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8871F7AXK2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8871F7AXK2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8871F7AXK2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8871F7AXK2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8871F7AXK2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8871F7AXK2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8871F7AXK2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8871F7AXK2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8871F7AXK2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms