Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf165E9QAU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf165E9QAU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf165E9QAU8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf165E9QAU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf165E9QAU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf165E9QAU8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf165E9QAU8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms