Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nolc1E9Q5C9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nolc1E9Q5C9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nolc1E9Q5C9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Nolc1E9Q5C9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nolc1E9Q5C9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nolc1E9Q5C9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nolc1E9Q5C9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nolc1E9Q5C9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nolc1E9Q5C9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nolc1E9Q5C9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nolc1E9Q5C9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Nolc1E9Q5C9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nolc1E9Q5C9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nolc1E9Q5C9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nolc1E9Q5C9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nolc1E9Q5C9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nolc1E9Q5C9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms