Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930579F01RikE9Q3L6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930579F01RikE9Q3L6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms