Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FgaE9PV24 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FgaE9PV24 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FgaE9PV24 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FgaE9PV24 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FgaE9PV24 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FgaE9PV24 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FgaE9PV24 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FgaE9PV24 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FgaE9PV24 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FgaE9PV24 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FgaE9PV24 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FgaE9PV24 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FgaE9PV24 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FgaE9PV24 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FgaE9PV24 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FgaE9PV24 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FgaE9PV24 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FgaE9PV24 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FgaE9PV24 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FgaE9PV24 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FgaE9PV24 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FgaE9PV24 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms