Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc24E9PUW8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc24E9PUW8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc24E9PUW8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc24E9PUW8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc24E9PUW8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc24E9PUW8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc24E9PUW8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc24E9PUW8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms