Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc13D3YV10 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc13D3YV10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc13D3YV10 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc13D3YV10 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc13D3YV10 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc13D3YV10 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc13D3YV10 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc13D3YV10 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc13D3YV10 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc13D3YV10 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc13D3YV10 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc13D3YV10 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc13D3YV10 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms