Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd8B9EJ80 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzd8B9EJ80 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd8B9EJ80 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd8B9EJ80 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd8B9EJ80 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd8B9EJ80 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms