Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mterf1bB9EJ57 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mterf1bB9EJ57 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mterf1bB9EJ57 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mterf1bB9EJ57 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mterf1bB9EJ57 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mterf1bB9EJ57 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mterf1bB9EJ57 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms