Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga9B8JK39 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga9B8JK39 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga9B8JK39 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga9B8JK39 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga9B8JK39 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga9B8JK39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga9B8JK39 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itga9B8JK39 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga9B8JK39 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga9B8JK39 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms