Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam71aB7XG49 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam71aB7XG49 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam71aB7XG49 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam71aB7XG49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam71aB7XG49 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam71aB7XG49 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam71aB7XG49 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam71aB7XG49 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam71aB7XG49 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam71aB7XG49 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam71aB7XG49 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam71aB7XG49 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam71aB7XG49 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam71aB7XG49 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71aB7XG49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71aB7XG49 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71aB7XG49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam71aB7XG49 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam71aB7XG49 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71aB7XG49 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71aB7XG49 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam71aB7XG49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam71aB7XG49 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71aB7XG49 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71aB7XG49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71aB7XG49 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71aB7XG49 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71aB7XG49 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71aB7XG49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam71aB7XG49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms