Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AU015836B2RUM3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
AU015836B2RUM3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AU015836B2RUM3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AU015836B2RUM3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AU015836B2RUM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AU015836B2RUM3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AU015836B2RUM3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AU015836B2RUM3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU015836B2RUM3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU015836B2RUM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU015836B2RUM3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AU015836B2RUM3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU015836B2RUM3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU015836B2RUM3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU015836B2RUM3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
AU015836B2RUM3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AU015836B2RUM3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AU015836B2RUM3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AU015836B2RUM3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AU015836B2RUM3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AU015836B2RUM3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AU015836B2RUM3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AU015836B2RUM3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AU015836B2RUM3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AU015836B2RUM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AU015836B2RUM3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AU015836B2RUM3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AU015836B2RUM3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms