Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud3B1AZ99 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Otud3B1AZ99 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud3B1AZ99 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud3B1AZ99 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otud3B1AZ99 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud3B1AZ99 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud3B1AZ99 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud3B1AZ99 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud3B1AZ99 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud3B1AZ99 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud3B1AZ99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud3B1AZ99 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud3B1AZ99 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud3B1AZ99 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otud3B1AZ99 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud3B1AZ99 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud3B1AZ99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms